SPEC_02 // Hela-Ecosystem-MCPDOSIR: TOPOLOGI_DUAL_BACKBONE

Arsitektur Ekosistem

Dua tulang punggung (backbone) mengoordinasikan sepuluh sel melalui standar MCP stdio (JSON-RPC 2.0). Mitosis merencanakan dan merutekan tugas; Genome mengingat memori persisten. Setiap sel lainnya bersifat stateless di balik batas domainnya.

Peta topologi organel Blotcat — **GMBAR.**PELAT 02 · blotcat-architecture.jpg · Peta dual-backbone

Dual Backbone

TABEL 2.1 — PEMBAGIAN TANGGUNG JAWAB BACKBONE
Backbone	Menangani & Memiliki	Tidak Pernah Menangani
Mitosis (`hela-mitosis`)	Penalaran bertahap, dekomposisi tugas, perutean rantai alat, template prompt	Status persisten
Genome (`hela-genome`)	Grafik pengetahuan SQLite, entitas/relasi, konteks sesi, sinkronisasi sentral	Keputusan eksekusi

Aturan interaksi: agen berpikir melalui Mitosis, menyimpan memori melalui Genome, dan bertindak melalui sel-sel lainnya. Sinergi terverifikasi (lihat npm test): Mitosis+Genome (backbone), Enzyme+Cytosol (riset), Membrane+Nucleus+Ribosome (workspace).

Transport Komunikasi

Semua sel berkomunikasi melalui protokol MCP via stdio: JSON-RPC 2.0 per baris pada stdin/stdout, dan log pada stderr. Tanpa port terbuka, tanpa autentikasi jaringan, tanpa latensi soket — klien mengeksekusi node <dir>/<entry> sesuai config/inventory.json. Pin revisi commit per sel memastikan instalasi selalu deterministik (gunakan flag --dev jika ingin mengikuti branch aktif).

Referensi Server & Organel

Sepuluh sel. Cakupan CORE berjalan murni headless; SPECIALIZED membutuhkan GUI, emulator perangkat, atau dependensi runtime khusus.

HeLa Mitosis

hela-mitosis · chaining-mcp · CORE · 29 alat

Pembagian kognitif dan orkestrasi alur kerja. Dilengkapi runtime agen Needle 3 terbundel (rencana → eksekusi → observasi, sepenuhnya offline), penemuan alat peer, penalaran sekuensial bertenaga Needle, dekomposisi tugas, 40 template prompt domain, katalog skills, dan eskalasi opsional OpenRouter (X-Title: hela-mitosis).

entry dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/chaining-mcp · env OPENROUTER_API_KEY, CHAINING_LLM_MODEL, CHAINING_LLM_ENABLED, GITHUB_TOKEN…

agent_run, analyze_with_sequential_thinking, sequentialthinking, workflow_orchestrator, workflow_status, workflow_cancel, llm_decompose_task, llm_suggest_route, llm_query, llm_summarize, list_skills, search_skills, get_skill, suggest_skill_chain, search_prompts, get_prompt, list_mcp_servers, validate_tool_chain

HeLa Genome

hela-genome · project-mcp · CORE · 26 alat

Grafik pengetahuan SQLite hidup (memory.db) dengan pencarian teks penuh FTS5, pelacakan relasi entitas, pemulihan konteks lintas-sesi, dan pemindaian rahasia/kredensial.

entry dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/project-mcp

initialize_memory, memory_edit, read_graph, search_nodes, open_node, get_file_context, get_timeline, get_session_context, sync_central_memory, execute_sql, query_data, inspect_untrusted_text, security_scan

HeLa Membrane

hela-membrane · filesystem-mcp · CORE · 16 alat

Batas sistem berkas terisolasi: pencarian rekursif, pengawasan berkas (file watch), inspeksi biner, dan ekstraksi arsip.

entry dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/filesystem-mcp

read_file, write_file, copy_file, move_file, delete_file, get_file_info, create_directory, list_directory, find_files, search_in_files, watch_file, archive_files, extract_archive

HeLa Nucleus

hela-nucleus · terminal-mcp · CORE · 7 alat

Eksekusi perintah terisolasi dengan pembatasan subshell aman dan optimasi token RTK.

entry build/index.js · repo Hela-Ecosystem/terminal-mcp

execute_command, transfer_file, terminal_ls, terminal_grep, terminal_cat, terminal_session_close, terminal_session_list

HeLa Ribosome

hela-ribosome · menager-mcp · CORE · 28 alat

Multiplexing proses PTY polyglot ditambah kontrol plane opencode bawaan: spawn/send/fork sesi agen terarah, penemuan model, statistik penggunaan, dan instance serve cepat.

entry build/index.js · repo Hela-Ecosystem/menager-mcp

session_spawn, session_write, session_read, session_hook, session_wait, session_close, agent_spawn, agent_send, agent_fork, agent_list, opencode_models, opencode_server_spawn

HeLa Enzyme

hela-enzyme · researcher-mcp · CORE · 24 alat

Pencarian web zero-key dual-tier + arXiv + Google News RSS + riset Wikipedia dengan sistem cache, pemeriksa fakta, dan fan-out satu panggilan research_brief (sumber paralel, dedup lintas sumber, stempel kesegaran).

entry dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/researcher-mcp · env GOOGLE_API_KEY, GOOGLE_CSE_ID, WIKIPEDIA_*

google_search, wikipedia_search, wikipedia_get, fact_checker, academic_search, content_summarizer, extract_content, research_brief, keyword_extraction

HeLa Cytosol

hela-cytosol · browser-mcp · CORE · 73 alat

Otomasi penuh Playwright: persepsi hierarki pohon aksesibilitas (AX-tree), pengisian formulir multi-tipe, intersep jaringan, tangkapan layar, dan persistensi sesi.

entry src/server.js · repo Hela-Ecosystem/browser-mcp

browser_navigate, browser_click, browser_fill_form, browser_screenshot, browser_get_content, browser_intercept, browser_extract_schema

HeLa Phenotype

hela-phenotype · designer-mcp · SPECIALIZED · 28 alat

Teori Desain sebagai Layanan: token warna OKLCH, referensi merek terkenal (Linear, Stripe…), sintesis Tailwind, komponen 8-state, audit aksesibilitas WCAG, dan gerbang anti-slop.

entry dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/designer-mcp

generate_rules, design_tokens, palette, brand_fetch_design_md, generate_8state_component, design_audit, evaluate_style, logo_workflow

HeLa Receptor

hela-receptor · scrcpy-mcp · SPECIALIZED · 46 alat

Otomasi Android melalui ADB: inspeksi hierarki XML antarmuka, sentuhan tap/swipe/text, perekaman layar, dan siklus hidup aplikasi. Membutuhkan perangkat fisik atau emulator.

entry dist/server.js · repo Hela-Ecosystem/scrcpy-mcp

start_session, device_list, device_info, ui_dump, ui_find_element, tap, swipe, input_text, key_event, screenshot, screen_record_start, app_install, shell_exec

HeLa Plastid

hela-plastid · ll3m-mcp · SPECIALIZED · 15 alat

Pemodelan Blender otonom: rencana → skrip prosedural → render → simpan berkas .blend. Membutuhkan instalasi Blender 4+.

entry brain/dist/index.js · repo Hela-Ecosystem/ll3m-mcp

generate_modeling_plan, execute_blender_code, get_scene_summary, render_output, save_blend, get_screenshot, get_fast_feedback